赫章中医医院儿科门诊于2020年9月1日正式成立，住院部于2021年1月28日成立。为广州中医药大学深圳医院重点帮扶科室，先后有儿科帮扶专家黄文娴、张俊绮坐诊带教，现有广州市番禺区第六人民医院儿科专家黄雨晴坐诊，由丁永贵副主任医师任学科带头人，是具有医疗保健功能的临床科室。
住院部共建床位32张，儿科门诊配有儿科诊室、生长发育门诊、配药室、雾化外治室以及针灸推拿室。
2023年8月，上海市名中医吴敏工作室赫章工作站正式挂牌儿科，导师为医学硕士，博士研究生导师，博士后站合作导师，上海中医药大学兼职教授，海派徐氏儿科第四代传人，上海市名中医吴敏。儿科副主任王康宇、儿科主治医师赵银娥于2023年8月19日正式拜入上海市名中医吴敏教授门下，正式成为上海市名中医吴敏工作站的弟子。
儿科擅长运用中西医理论对儿童生长发育情况进行评估，运用中西医结合治疗矮小症、性早熟、儿童肥胖症及指导儿童保健。对生长发育迟缓、体弱儿中医调理有丰富的临床经验。擅长中西医结合治疗小儿呼吸系统疾病及消化道系统疾病等常见疾病。
科室中医特色明显，以小儿肺系、脾胃系疾病为重点，以小儿咳嗽、肺炎喘嗽、泄泻为优势病种，在门诊以中医治疗为特色，住院部以中西医结合治疗为主，开展中医外治、小儿推拿等适宜技术。其中中医外治疗法包括：耳穴埋豆、穴位贴敷、中药熏洗、小儿推拿、迎香穴埋针、中药直肠滴入等。对小儿呼吸道疾病、消化道疾病、厌食、增强免疫功能、调理体质、内分泌失调等疾病具有良好功效。
